246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2431 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  76.23 
 
 		 280 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  68.94 
 
 		 264 aa  357  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  65.91 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  64.77 
 
 		 264 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  65.91 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  49.43 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  49.81 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  49.43 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  48.68 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  49.06 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  45.83 
 
 		 267 aa  221  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  50.87 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  45.45 
 
 		 264 aa  198  7e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  43.82 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  41.83 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  43.04 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  40.82 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  41.44 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  41.92 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  38.87 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  36.02 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  34.62 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  47.39 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  35.61 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  38.85 
 
 		 280 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  39.23 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  31.18 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.85 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.7 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.74 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25.19 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.57 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.12 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.88 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.02 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.87 
 
 		 250 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  29.17 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.1 
 
 		 214 aa  86.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.09 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.09 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.09 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  28.7 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  29.63 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  28.99 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.31 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.14 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.84 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.76 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.44 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.26 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  24.7 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  27.73 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.65 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  32.67 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  34.46 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  32.58 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.93 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  31.63 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  28.24 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.47 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  32.97 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  25.49 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  34.81 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.24 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  27.73 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.1 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  30.92 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.25 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  29.64 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  27.33 
 
 		 259 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  27.24 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  24.29 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  28.1 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  27.24 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.84 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.84 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  34.64 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  25.87 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  34.59 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  34.59 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  31.53 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  24.11 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>