155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2682 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  497  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  95.9 
 
 		 244 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  95.47 
 
 		 244 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  86.07 
 
 		 244 aa  410  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  69.83 
 
 		 248 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  70.25 
 
 		 248 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  71.07 
 
 		 248 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  74.14 
 
 		 231 aa  325  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  67.83 
 
 		 233 aa  297  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  54.55 
 
 		 246 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  53.44 
 
 		 252 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  56.97 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  56.15 
 
 		 251 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  54.1 
 
 		 256 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  52.07 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  48.22 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  39.59 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  39.16 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  34.25 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.88 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  35.02 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  35.46 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  33.73 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  32.05 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  36.46 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  36.46 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  36.46 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  36.46 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  35.94 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  34.85 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  34.42 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.48 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.65 
 
 		 250 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.09 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  31.65 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.4 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  37.17 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.73 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.79 
 
 		 263 aa  81.6  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.68 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  32.14 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  32.62 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  31.03 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  26.89 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.61 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.41 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.39 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.64 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.51 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.39 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.21 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  26.59 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  26.59 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.05 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.63 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.95 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.56 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.24 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  31.23 
 
 		 251 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.48 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  28.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.97 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.91 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.14 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.75 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  30.09 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  29.49 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.35 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28.84 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.32 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  28.3 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.34 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  27.37 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.89 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  30.37 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  36.45 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  27.42 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>