132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2600 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  534  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  53.33 
 
 
252 aa  265  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  49.01 
 
 
246 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  49.61 
 
 
248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  49.21 
 
 
248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  49.61 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  49.03 
 
 
264 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  51.19 
 
 
251 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  48.41 
 
 
256 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  47.24 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  52.5 
 
 
233 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  45.45 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  46.25 
 
 
244 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  48.22 
 
 
244 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  47.93 
 
 
231 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  46.53 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  34.21 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  36.32 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  36.32 
 
 
261 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 
258 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  32.82 
 
 
254 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  34.26 
 
 
287 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  37.24 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  37.24 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  36.73 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  37.24 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  34.48 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  36.22 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  32.81 
 
 
255 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  39.18 
 
 
252 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  41.84 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.11 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.12 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.73 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  34.92 
 
 
259 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.57 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  28.82 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  32.39 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.28 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  29.21 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.12 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  26.58 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.56 
 
 
242 aa  65.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.44 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  25.1 
 
 
260 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.84 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  26.32 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  26.42 
 
 
224 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  26.42 
 
 
224 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  27.84 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  25.58 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  31.16 
 
 
263 aa  52.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  24.36 
 
 
263 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  26.42 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  26.85 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  27.04 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.73 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  24.42 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  30.83 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.31 
 
 
265 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  25.38 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  22.01 
 
 
266 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  26.19 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  25.93 
 
 
301 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  30.6 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  29.13 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.76 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  24.75 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  26.9 
 
 
278 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  30.21 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  27.82 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  26.98 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  23.81 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  31.29 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  25.77 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.64 
 
 
252 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  24.68 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  26.98 
 
 
224 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  29.23 
 
 
342 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27.94 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.29 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  24.81 
 
 
280 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  31.47 
 
 
252 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  25.42 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  27.92 
 
 
322 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>