225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0886 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  37.21 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  35.83 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.83 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  37.43 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.62 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.51 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30.45 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  34.01 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.02 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.02 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  25.1 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.2 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  28.39 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.89 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  26.92 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.48 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.91 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.94 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  32.12 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  30.59 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.41 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.96 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  29.58 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  27.27 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.47 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.96 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  29.9 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.58 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  29.01 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  31.28 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  27.41 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  29.38 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  29.71 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  23.46 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.15 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  24.8 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  24.79 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.34 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  29.59 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  26.96 
 
 		 265 aa  62  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  35.06 
 
 		 268 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  28.11 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  35.5 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  27.4 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  28.1 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  26.02 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  26.02 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.9 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  24.79 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.54 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.1 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.25 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  25.74 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  26.26 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  24.29 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.62 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.8 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  29.35 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.3 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.6 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  30.91 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  29.45 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  27.54 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  29.7 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  30.59 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.38 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  28.31 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  38.95 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  29.01 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>