236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0039 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  96.02 
 
 
266 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  75.7 
 
 
251 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  58.43 
 
 
255 aa  305  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  56.86 
 
 
255 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  51.98 
 
 
253 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  35.66 
 
 
263 aa  154  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  37.87 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  37.27 
 
 
260 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  37.27 
 
 
224 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  37.27 
 
 
224 aa  149  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  36.77 
 
 
224 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  36.56 
 
 
224 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  36.56 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  35.32 
 
 
258 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  31.89 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  34.19 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  33.03 
 
 
225 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  31.96 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  33.49 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  39.66 
 
 
240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  27.6 
 
 
263 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  27.2 
 
 
272 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  34.27 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.64 
 
 
242 aa  79  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.45 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.11 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.25 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.7 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.79 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  23.87 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  29.19 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  31.79 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.47 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.62 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.83 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  26.25 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  29.21 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  28.89 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  26.32 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.79 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  26.42 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  30.4 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.72 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  28.86 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.07 
 
 
280 aa  62.4  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  27.87 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  30.08 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  37.21 
 
 
346 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  27.03 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  27.03 
 
 
344 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  27.03 
 
 
345 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  27.03 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  27.03 
 
 
344 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  28.07 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.1 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  27.03 
 
 
345 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.1 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.1 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.1 
 
 
185 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  27.03 
 
 
345 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  27.48 
 
 
278 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.93 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.36 
 
 
262 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  24.5 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.82 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  33.88 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.59 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 
265 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  31.11 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  28.77 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  26.35 
 
 
345 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.34 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  33.88 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  24.29 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  26.35 
 
 
345 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.93 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.52 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.74 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.85 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.14 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  26.91 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.14 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.14 
 
 
258 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>