185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1739 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  64.19 
 
 
225 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  62.45 
 
 
262 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  53.27 
 
 
301 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  55.34 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  55.34 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  55.34 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  55.34 
 
 
240 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  55.34 
 
 
240 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  55.34 
 
 
240 aa  209  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  48.25 
 
 
224 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  47.81 
 
 
224 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  47.81 
 
 
224 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  47.37 
 
 
260 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  45.61 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  46.49 
 
 
224 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  46.93 
 
 
224 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  33.96 
 
 
266 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  33.49 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  35.91 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  33.62 
 
 
253 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  31.82 
 
 
263 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  32.61 
 
 
255 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  34.97 
 
 
255 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  30.45 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  28.65 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  34.62 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.84 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  29.59 
 
 
236 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 
272 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  23.79 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  23.79 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.43 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.9 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.51 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  34.13 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.2 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.39 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.46 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.43 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  32.61 
 
 
345 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  35.97 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.85 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.85 
 
 
265 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.1 
 
 
256 aa  55.5  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.84 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  29.55 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  31.62 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  33.58 
 
 
280 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  29.71 
 
 
344 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.17 
 
 
265 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.17 
 
 
278 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.65 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  29.71 
 
 
344 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.07 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.07 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.33 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.33 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  28.99 
 
 
345 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  32.26 
 
 
252 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.82 
 
 
280 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  29.28 
 
 
253 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  28.5 
 
 
247 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.35 
 
 
256 aa  52  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
334 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  33.07 
 
 
333 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  28.99 
 
 
345 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  28.99 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  28.99 
 
 
345 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  28.99 
 
 
345 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  28.99 
 
 
345 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  31.06 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  23.26 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  28.99 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  29.21 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.12 
 
 
275 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  26.81 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.53 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  32 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  28.4 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  30.28 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.93 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  33.8 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.89 
 
 
281 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  31.39 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  26.79 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  30.47 
 
 
322 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  30.47 
 
 
322 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>