119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2924 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  50.23 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  47.87 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  43.32 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  38.49 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  39.43 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  40.69 
 
 		 253 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  46.86 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  43.2 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  35.51 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  33.61 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  39.22 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  36.86 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  36.16 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  35.08 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  38.69 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  36.44 
 
 		 253 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  35.09 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  34.09 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  35.96 
 
 		 253 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  36.84 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  38.95 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  30.52 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  38.51 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.28 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.2 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.2 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.22 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  25.1 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.3 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.09 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  33.83 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  33.16 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.78 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.53 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  31.55 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  33.68 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  25.97 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  33.14 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  32.07 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  27.61 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.76 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  32.74 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.24 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  32.41 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.51 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.76 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  32.48 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  35.25 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  25.51 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  36.76 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  31.45 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.32 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.11 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.36 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.72 
 
 		 265 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.72 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.28 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  24.91 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2389  hypothetical protein  30.72 
 
 		 191 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  32 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.67 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  32.24 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  32.89 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.25 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  33.1 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  40.15 
 
 		 206 aa  49.7  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  34.43 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  37 
 
 		 264 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.43 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  28.9 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  34.17 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  41.24 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.48 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.59 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.71 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.22 
 
 		 273 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.67 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.74 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26581  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>