131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0451 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  45.27 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  38.91 
 
 
251 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  37.23 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  39.39 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  38.22 
 
 
253 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  43.56 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  41.2 
 
 
251 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  36.49 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  36.49 
 
 
253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  37.39 
 
 
256 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  35.59 
 
 
253 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  37.73 
 
 
253 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  37.83 
 
 
256 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  40.77 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.99 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  37.74 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  37.56 
 
 
247 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  36.82 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  37.43 
 
 
266 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  38.69 
 
 
271 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  36.13 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  40.74 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  32.79 
 
 
263 aa  87  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  36.14 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32.31 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  33.06 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.33 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.9 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.25 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.97 
 
 
266 aa  79  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.97 
 
 
264 aa  79  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.02 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.97 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  29.83 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  33.91 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.17 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  33.67 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  29.2 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.98 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  30.45 
 
 
254 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  34.2 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  27.71 
 
 
301 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  34.2 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.15 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.98 
 
 
259 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  29.61 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.09 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  34.13 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.7 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  32.22 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.95 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  30.45 
 
 
252 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  30.36 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  28.72 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.3 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  29.27 
 
 
264 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  27.43 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.64 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  26.75 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  28.85 
 
 
250 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.78 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.8 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  32.43 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  32.43 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  28.26 
 
 
224 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.84 
 
 
262 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.79 
 
 
267 aa  52  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.44 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  35.64 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  26.7 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  27.16 
 
 
281 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25.12 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  29.49 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.43 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  30.67 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  27.78 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.43 
 
 
281 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.71 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  34.58 
 
 
334 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.07 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  29.66 
 
 
253 aa  48.5  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.64 
 
 
282 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  28.74 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  28.66 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.34 
 
 
192 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  35.16 
 
 
268 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  31.9 
 
 
246 aa  47  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>