156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4400 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  31.46 
 
 
263 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  36.13 
 
 
265 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  35.71 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  34.85 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  36.13 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.86 
 
 
262 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.54 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.24 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30.36 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.02 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  26.48 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  28.65 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.49 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.72 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.53 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  26.98 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  27.13 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  35.4 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.85 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  27.19 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.47 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  31.85 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  28.42 
 
 
252 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  24.15 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  28.95 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  35.4 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.67 
 
 
214 aa  63.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  26.87 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  30.22 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.62 
 
 
192 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.88 
 
 
280 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.48 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  26.32 
 
 
251 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  24.27 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  24.35 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  35.97 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  30.05 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  35.42 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  25.82 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.13 
 
 
247 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  28.72 
 
 
230 aa  55.5  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25.78 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  24.18 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  25.4 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  26.34 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  25.29 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  30.08 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  30.17 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  38.54 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  25.38 
 
 
205 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.96 
 
 
235 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2300  hypothetical protein  43.86 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  25.87 
 
 
266 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  25.68 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 
278 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  29.75 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  25.68 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.88 
 
 
259 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25.13 
 
 
236 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  26.59 
 
 
211 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.49 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  32.93 
 
 
211 aa  52.4  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  30.67 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  26.37 
 
 
196 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  27.59 
 
 
266 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  27.34 
 
 
281 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.9 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  33.81 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  27.51 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  27.7 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  25.79 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  27.55 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  34.72 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  34.29 
 
 
225 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  30.83 
 
 
215 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  31.03 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  28.41 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  27.14 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  48.5  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  25.93 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  25.93 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.26 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  24.54 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3988  protein of unknown function DUF218  28.36 
 
 
433 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672563  normal  0.593684 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  24.88 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  29.38 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  27.37 
 
 
197 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  28.19 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  25.14 
 
 
196 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  27.37 
 
 
210 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>