158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1372 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  99.55 
 
 
224 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  83.04 
 
 
224 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  82.59 
 
 
224 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  82.59 
 
 
224 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  82.14 
 
 
260 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  72.77 
 
 
281 aa  341  7e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  63 
 
 
301 aa  278  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  59.47 
 
 
240 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  59.47 
 
 
240 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  59.47 
 
 
240 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  59.47 
 
 
240 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  59.47 
 
 
240 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  59.03 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  50 
 
 
225 aa  205  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  46.93 
 
 
228 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  49.12 
 
 
262 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  41.14 
 
 
251 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  39.43 
 
 
251 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  39.43 
 
 
266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  35.11 
 
 
253 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  33.63 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  34.43 
 
 
255 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  32.29 
 
 
263 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  32.11 
 
 
258 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  27.16 
 
 
277 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  36.99 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
272 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  25.35 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  34.59 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25.74 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  24.66 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.31 
 
 
260 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.41 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  34.62 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.77 
 
 
251 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  35.38 
 
 
280 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.51 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.3 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  26.24 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  29.61 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.84 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.76 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  25.56 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 
262 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  33.08 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.61 
 
 
252 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.24 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  23.16 
 
 
272 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  23.16 
 
 
263 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.7 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  28.99 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  32.35 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.93 
 
 
284 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.55 
 
 
273 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  31.11 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  36.17 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  29.2 
 
 
253 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.83 
 
 
263 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  26.97 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  35.29 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.06 
 
 
268 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.28 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  29.78 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.85 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  29.19 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  29.11 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.78 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  27.85 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  27.32 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.61 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  25.4 
 
 
271 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 
334 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.61 
 
 
265 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  26.15 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  31.85 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  25.44 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  29.78 
 
 
253 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.96 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  30.19 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  32.84 
 
 
262 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.83 
 
 
281 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.92 
 
 
262 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  27.55 
 
 
247 aa  48.5  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  33.33 
 
 
262 aa  48.5  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.43 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  32.82 
 
 
337 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>