48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1471 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  529  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  96.5 
 
 
265 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0773  hypothetical protein  44.6 
 
 
300 aa  221  8e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262461  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  31.28 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.38 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  28.9 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  58.9  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  32.89 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  35 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.14 
 
 
264 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  33.14 
 
 
266 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30.06 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  27.95 
 
 
334 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  28.75 
 
 
215 aa  52.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  27.78 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  29.12 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  31.87 
 
 
251 aa  49.3  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  30 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  29.19 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  28.44 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  27.8 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
210 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  28.9 
 
 
253 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.27 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.56 
 
 
219 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  26.72 
 
 
262 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  32.2 
 
 
251 aa  45.4  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  28.7 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.33 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  28.89 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  29.07 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  29.1 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  29.93 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  27.54 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  24.63 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  32.7 
 
 
240 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  32.7 
 
 
240 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  42  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  24.22 
 
 
185 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  24.22 
 
 
185 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  24.22 
 
 
185 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  24.22 
 
 
185 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  31.11 
 
 
271 aa  42  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.63 
 
 
264 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>