280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1772 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  42.58 
 
 
258 aa  195  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  41 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  36.6 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  35.09 
 
 
257 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  42.31 
 
 
185 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  41.98 
 
 
192 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  45.03 
 
 
194 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  42.59 
 
 
192 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  41.36 
 
 
192 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  41.42 
 
 
192 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  41.42 
 
 
192 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  43.79 
 
 
185 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  41.42 
 
 
172 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  45.7 
 
 
159 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  41.42 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  41.98 
 
 
192 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  41.25 
 
 
206 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  39.87 
 
 
193 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  38.92 
 
 
206 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  43.14 
 
 
185 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  41.03 
 
 
243 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  42.48 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  42.48 
 
 
178 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  38.41 
 
 
342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  41.83 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  31.91 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  31.56 
 
 
337 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  39.87 
 
 
185 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  39.87 
 
 
185 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  39.87 
 
 
185 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  39.87 
 
 
185 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  31.25 
 
 
267 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  39.87 
 
 
185 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  36.84 
 
 
344 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  32.55 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  36.84 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  36.84 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  32.2 
 
 
264 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  36.84 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  36.84 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  36.84 
 
 
345 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  36.18 
 
 
345 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  36.18 
 
 
344 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  35.53 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  36.18 
 
 
345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  32.68 
 
 
259 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  37.23 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  34.64 
 
 
345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  33.15 
 
 
251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  35.71 
 
 
373 aa  111  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  32.31 
 
 
365 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  32.94 
 
 
322 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  32.94 
 
 
322 aa  108  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
393 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  38.99 
 
 
350 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  36.11 
 
 
178 aa  106  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  30.67 
 
 
378 aa  105  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  30.18 
 
 
253 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  33.14 
 
 
318 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  31.03 
 
 
271 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  33.51 
 
 
336 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.57 
 
 
195 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.37 
 
 
192 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  29.87 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  29.19 
 
 
206 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  29.87 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  29.19 
 
 
206 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 
348 aa  85.5  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  29.24 
 
 
208 aa  82  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  31.69 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  31.18 
 
 
361 aa  75.9  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  36 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  25.37 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  29.32 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  29.6 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  26.46 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.88 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.49 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  26.14 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  27.95 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  26.45 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  26.67 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  25.79 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  30.72 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  25.99 
 
 
210 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  30.25 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  28.99 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  27.12 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  26.15 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  36.07 
 
 
334 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  29.01 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  25.64 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  25.64 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  25.64 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  25.64 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>