29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0773 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0773  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  622  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262461  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  44.96 
 
 
265 aa  226  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  44.6 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32.41 
 
 
251 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  34.74 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  34.74 
 
 
237 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.32 
 
 
219 aa  52.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  31.71 
 
 
236 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  24.57 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  26.01 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  36.84 
 
 
178 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  29.09 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  36.84 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.82 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  35.09 
 
 
185 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  30.23 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  29.87 
 
 
185 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  29.87 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  29.87 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  29.87 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  29.87 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  29.87 
 
 
185 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 
279 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  35.09 
 
 
185 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  27.12 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  28.67 
 
 
253 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>