50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0947 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  96.5 
 
 		 257 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0773  hypothetical protein  44.96 
 
 		 300 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.9 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.96 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.8 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  31.37 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  29 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  29.71 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.37 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.37 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  28.12 
 
 		 215 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  30.67 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  24.14 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  28.74 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  28.9 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.21 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  28.65 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  24.14 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  24.69 
 
 		 185 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  35.96 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.56 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.27 
 
 		 254 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  29.06 
 
 		 253 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.36 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  27.17 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  25.95 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  29.87 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  24.83 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  24.83 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  24.83 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  24.83 
 
 		 185 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  27.78 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  26.92 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 		 265 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  30.36 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  29.87 
 
 		 185 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.63 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  23.57 
 
 		 185 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01531  hypothetical protein  27.61 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.95 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  30.05 
 
 		 253 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  24.63 
 
 		 258 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>