133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4535 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
334 aa  658    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 
253 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  30.13 
 
 
346 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  28.97 
 
 
375 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  28.97 
 
 
375 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  28.97 
 
 
375 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  41.73 
 
 
193 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  41.73 
 
 
193 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  44.09 
 
 
233 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  40.94 
 
 
193 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  45.67 
 
 
202 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  29.33 
 
 
365 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  34.88 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  36.07 
 
 
262 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  34.51 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  38.89 
 
 
257 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  31.98 
 
 
257 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  40.24 
 
 
240 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  40.24 
 
 
240 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  32.76 
 
 
207 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  40.24 
 
 
240 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  40.24 
 
 
240 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  40.24 
 
 
240 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  40.24 
 
 
240 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  31.3 
 
 
206 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  40.57 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  32.41 
 
 
247 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  38.46 
 
 
255 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  34.01 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  32.09 
 
 
246 aa  56.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  31.47 
 
 
235 aa  56.2  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  36.11 
 
 
255 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  35.11 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  31.39 
 
 
225 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  37.65 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.93 
 
 
251 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  36.07 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  35.29 
 
 
252 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.53 
 
 
215 aa  53.5  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  33.56 
 
 
251 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  33.56 
 
 
224 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.77 
 
 
199 aa  52.8  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  33.56 
 
 
224 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
247 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  33.56 
 
 
260 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1471  hypothetical protein  27.95 
 
 
257 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.61 
 
 
237 aa  52.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  34.48 
 
 
266 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  34.48 
 
 
264 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  35.07 
 
 
337 aa  52.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  35.61 
 
 
237 aa  52  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  27.03 
 
 
185 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  27.03 
 
 
185 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  26.35 
 
 
178 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  34.78 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  34.78 
 
 
322 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
262 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  31.97 
 
 
256 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  27.81 
 
 
185 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  26.35 
 
 
185 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  32.39 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  25.97 
 
 
337 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  33.86 
 
 
350 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 
264 aa  50.1  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  33.05 
 
 
228 aa  50.1  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0947  hypothetical protein  28.68 
 
 
265 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  32.39 
 
 
224 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  34.58 
 
 
230 aa  49.7  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  38.3 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  32.26 
 
 
178 aa  48.5  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  30.43 
 
 
253 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.48 
 
 
199 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  38.24 
 
 
262 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  25.81 
 
 
236 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  29.93 
 
 
219 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  28.15 
 
 
165 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.33 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  28.18 
 
 
185 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  38.3 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  34.07 
 
 
263 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  29.31 
 
 
365 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  26.49 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  35.64 
 
 
266 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  27.68 
 
 
190 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  32.09 
 
 
256 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  36.71 
 
 
280 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.79 
 
 
252 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  31.43 
 
 
153 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>