211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4675 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  57.14 
 
 		 337 aa  285  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  47.27 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  39.08 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  38.22 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  39.16 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  32.31 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  45.39 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  40.27 
 
 		 206 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  39.6 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  31.2 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  31.09 
 
 		 185 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  40.52 
 
 		 336 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  32.11 
 
 		 192 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  32.11 
 
 		 192 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  34.97 
 
 		 193 aa  89.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  34.42 
 
 		 192 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  34.64 
 
 		 172 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  34.64 
 
 		 192 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  34.42 
 
 		 192 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  28.08 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  34.42 
 
 		 194 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  31.79 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  37.42 
 
 		 393 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  28.08 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  32.21 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  36.49 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  36.49 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  33.77 
 
 		 159 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  33.77 
 
 		 192 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  30.89 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  35.71 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  35.71 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  35.71 
 
 		 345 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  36.49 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  35.81 
 
 		 178 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  35.81 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  32.65 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  35.14 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.97 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.97 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.97 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.97 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  37.31 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  32.12 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  33.12 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  36.55 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  33.16 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  37.01 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.61 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  36.24 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  33.04 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  29.65 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  29.65 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  29.65 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  33.04 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  33.04 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  34.64 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  31.08 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.25 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  27.08 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  30.85 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.32 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  39.13 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  31.37 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  28.99 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  32.65 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  38.26 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  38.26 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  28 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  36.5 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  30.92 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  37.8 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.82 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  35.46 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  32.48 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  34.29 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  31.17 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 		 346 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.96 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  38 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  35.66 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.83 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  36.52 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  28.4 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>