211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0463 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  45.38 
 
 
185 aa  117  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  40.27 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  36.11 
 
 
262 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  44.44 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  44.44 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  44.35 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  38.67 
 
 
246 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  44.35 
 
 
185 aa  106  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  44.35 
 
 
185 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  41.43 
 
 
192 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  33.53 
 
 
258 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  44.62 
 
 
192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  44.62 
 
 
192 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  43.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  44.62 
 
 
192 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  43.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  44.62 
 
 
192 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  43.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  41.43 
 
 
194 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  43.55 
 
 
185 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  44.62 
 
 
172 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  34.44 
 
 
206 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  40.71 
 
 
192 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  44.53 
 
 
159 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  43.75 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  34 
 
 
206 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  39.26 
 
 
322 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  39.26 
 
 
322 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  37.04 
 
 
318 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  36.84 
 
 
342 aa  87  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  31.4 
 
 
251 aa  86.3  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  37.18 
 
 
257 aa  85.9  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  35.95 
 
 
253 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  37.82 
 
 
257 aa  85.1  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  37.76 
 
 
333 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  33.16 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  33.78 
 
 
345 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  32.79 
 
 
280 aa  82.4  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  36.88 
 
 
337 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  33.78 
 
 
344 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  33.78 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  33.11 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  34.1 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  34.46 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  33.11 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  33.11 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  32.28 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  37.3 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  36.17 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  29.53 
 
 
378 aa  78.6  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  33.11 
 
 
345 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  32.43 
 
 
345 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  36.43 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  31.65 
 
 
365 aa  74.7  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  35.37 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  32.19 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  35.11 
 
 
350 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  35.56 
 
 
267 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  32.09 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  31.91 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  30.37 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  35.88 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  28.1 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  29.61 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  30.67 
 
 
373 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  33.87 
 
 
461 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  34.55 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  33.11 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  30.3 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.54 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
215 aa  64.7  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  29.2 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  30.65 
 
 
219 aa  64.3  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  31.54 
 
 
216 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  29.93 
 
 
267 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  31.54 
 
 
188 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.85 
 
 
205 aa  61.6  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  30.95 
 
 
335 aa  61.2  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  29.41 
 
 
264 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.2 
 
 
278 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  31.54 
 
 
219 aa  59.7  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  31.13 
 
 
348 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.65 
 
 
264 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.87 
 
 
280 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  33.88 
 
 
235 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 
231 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  35.77 
 
 
338 aa  58.2  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  28.48 
 
 
202 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  34.97 
 
 
189 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  29.92 
 
 
236 aa  58.2  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.71 
 
 
264 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  28.81 
 
 
361 aa  57.4  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  30.6 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>