196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06790 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
212 aa  437  9.999999999999999e-123  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  44.56 
 
 
215 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  49.32 
 
 
229 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  37.69 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  37.19 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  46.83 
 
 
216 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  37.71 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  37.34 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  37.04 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  34.78 
 
 
233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  32.84 
 
 
219 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  39.86 
 
 
248 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  40.29 
 
 
236 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  35.44 
 
 
270 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  38.89 
 
 
216 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  45.76 
 
 
201 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  39.02 
 
 
231 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  39.68 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  31.25 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  35.95 
 
 
226 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  33.74 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  31.91 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  31.02 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  30.89 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  39.34 
 
 
189 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  34.52 
 
 
190 aa  89.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  35 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  35 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  35 
 
 
230 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  35 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  25.58 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  30.46 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  34.17 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  34.17 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  33.33 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  33.33 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  38.78 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  33.33 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  33.33 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  33.33 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  23.62 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  33.33 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  34.93 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
370 aa  79  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  28.18 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  30.29 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  30.29 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  30.25 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  27.37 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  30.37 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.95 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  31.91 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  29.22 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  32.37 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  28.97 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  24.62 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  33.07 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  33.86 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  35.34 
 
 
181 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  28.97 
 
 
259 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  30.92 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  34.69 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  35.66 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  28.19 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  31.41 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  28.35 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  29.93 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  29.08 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  25.81 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.79 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  31.18 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  28.99 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  33.86 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  28.19 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  27.43 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  27.78 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  27.01 
 
 
345 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>