201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01910 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  100 
 
 
229 aa  474  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  48.13 
 
 
215 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  42.56 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  39.91 
 
 
223 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  39.45 
 
 
219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  41.57 
 
 
236 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  32.87 
 
 
216 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  40.59 
 
 
231 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  36.13 
 
 
216 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  35.29 
 
 
233 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  42.37 
 
 
213 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  38.16 
 
 
225 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  33.14 
 
 
219 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  38.36 
 
 
270 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  33.01 
 
 
226 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  36.9 
 
 
217 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  44.92 
 
 
216 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  39.04 
 
 
248 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  40.16 
 
 
236 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  33.67 
 
 
230 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  32.38 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  32.38 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  32.38 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  33.66 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  42.62 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  32.38 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  32.55 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  31.16 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  32.82 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  34.2 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  36.88 
 
 
188 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  31.43 
 
 
227 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  40.98 
 
 
226 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  36.77 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  36.77 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  36.77 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  36.77 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  36.77 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  31.55 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  36.22 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  30.17 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  34.38 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  35.14 
 
 
268 aa  82.8  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  30.11 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  32.84 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  32.12 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  34.65 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  34.65 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  32.92 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  37.01 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  37.01 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  37.01 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  37.01 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  37.01 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  27.98 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  29.55 
 
 
315 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  34.48 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  32.17 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  31.33 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  30.67 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  30.67 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  30.67 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  29.11 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  33.07 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  75.5  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  35.2 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  35.43 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  32.23 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  34.33 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  28.38 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  30.5 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  26.95 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  29.32 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  27.91 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  23.71 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  34.48 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  28.77 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  29.28 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  31.03 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  28.57 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  32.82 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  31.36 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  28.03 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>