173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3776 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  43.19 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  44.8 
 
 
264 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  43.24 
 
 
267 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  46.3 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  46.44 
 
 
253 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  46.67 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  35.6 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  32.55 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  31.12 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  31.38 
 
 
251 aa  98.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  28 
 
 
193 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  31.29 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  31.9 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  35.44 
 
 
192 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  34.84 
 
 
194 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  32.26 
 
 
192 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  32.26 
 
 
192 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  36.31 
 
 
192 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  36.54 
 
 
172 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  36.54 
 
 
192 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  36.31 
 
 
192 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  34.81 
 
 
192 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  36.31 
 
 
159 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  35.1 
 
 
271 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  36.31 
 
 
333 aa  83.2  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  40.38 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  32.11 
 
 
338 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  30.23 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  32.21 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  32.89 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  32.21 
 
 
185 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  32.9 
 
 
185 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  30.89 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  38.55 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  30.87 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  31.17 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  29.65 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  30.52 
 
 
185 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  30.52 
 
 
185 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  30.52 
 
 
185 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  30.52 
 
 
185 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  27.31 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  26.64 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  27.69 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  32.79 
 
 
178 aa  72  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  26.98 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  32.28 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  32.28 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  31.17 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  28.08 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  27.4 
 
 
344 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  26.54 
 
 
345 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  27.69 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  28.02 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  27.69 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  27.69 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  39.1 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  35.25 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  33.12 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  29.11 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  28.44 
 
 
373 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 
195 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  33.12 
 
 
350 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  30.86 
 
 
348 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  28.4 
 
 
365 aa  63.2  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  31.28 
 
 
245 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  37.82 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  36.57 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  32.03 
 
 
192 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  29.45 
 
 
223 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  34.19 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  38.22 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  29.73 
 
 
361 aa  59.7  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  30.6 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  26.82 
 
 
378 aa  57.4  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  32.7 
 
 
176 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  34.17 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  29.25 
 
 
202 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32 
 
 
260 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  28.76 
 
 
210 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  28.75 
 
 
188 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  35.34 
 
 
202 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.82 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  36.62 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.22 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  29.45 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.1 
 
 
210 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  34.96 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  34.96 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  34.96 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  33.54 
 
 
153 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  34.3 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>