250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3239 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
336 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  40.19 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  43.89 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  31.19 
 
 
344 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  31.19 
 
 
344 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
378 aa  159  8e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  34.09 
 
 
344 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  32.3 
 
 
345 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  38.7 
 
 
350 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  31.15 
 
 
344 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  32.13 
 
 
345 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  31.8 
 
 
345 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  42.25 
 
 
393 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  31.8 
 
 
345 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  31.8 
 
 
345 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  31.8 
 
 
345 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  31.8 
 
 
345 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  33.96 
 
 
342 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  32.9 
 
 
373 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  34.78 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  36.7 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  36.7 
 
 
322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  35.05 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  36.71 
 
 
257 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  36.71 
 
 
257 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  39.44 
 
 
335 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  39.07 
 
 
256 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  33.93 
 
 
271 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  34.73 
 
 
192 aa  102  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  35.46 
 
 
258 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  29.96 
 
 
262 aa  97.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  31.98 
 
 
206 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  34.39 
 
 
365 aa  93.2  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  39.88 
 
 
199 aa  92.8  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  30.81 
 
 
206 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  31.1 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  41.18 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  35.03 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  41.67 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  39.16 
 
 
181 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  36.24 
 
 
178 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  36.73 
 
 
246 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  36.24 
 
 
185 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  35.14 
 
 
185 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  34.78 
 
 
264 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  36.24 
 
 
185 aa  86.3  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  34.59 
 
 
185 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  30.29 
 
 
195 aa  85.5  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  33.96 
 
 
185 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  39.07 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  40.13 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  37.23 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  40.15 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  31.09 
 
 
192 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  34.52 
 
 
228 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  30.32 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  29.95 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  29.95 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  37.04 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  29.17 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  30.43 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  30.34 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  31.03 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  33.73 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  38.06 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  36.29 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  39.52 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  30.29 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  47.37 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  29.63 
 
 
192 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  34.97 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  32.9 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  29.52 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  38.69 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  30.26 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  37.12 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  34.69 
 
 
301 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  40.8 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  39.02 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  34.81 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  38.85 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  28.08 
 
 
219 aa  67  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  33.6 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  33.86 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  29.49 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  30.82 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  32.28 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  36.07 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  30.82 
 
 
237 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>