184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1277 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  68.28 
 
 		 228 aa  305  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  50.51 
 
 		 315 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  50.25 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  50 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  46.63 
 
 		 212 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  46.91 
 
 		 210 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  47.89 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  40 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  46.07 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  34.81 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  35.23 
 
 		 210 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  33.17 
 
 		 202 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  33.83 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  27.32 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  27.32 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  27.32 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  27.32 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.9 
 
 		 192 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  37.5 
 
 		 176 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  40.65 
 
 		 181 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 		 208 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  26.8 
 
 		 195 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.7 
 
 		 182 aa  89.4  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.7 
 
 		 182 aa  89.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  26.63 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  27.84 
 
 		 194 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  33.81 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  25.26 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  30.69 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  33.54 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  31.33 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  25.97 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  24.38 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  35.26 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  24.38 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  33.73 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  24.38 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  23.04 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  24.68 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  24.68 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  24.68 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  24.68 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  24.68 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.37 
 
 		 461 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  28.35 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  26.63 
 
 		 342 aa  68.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  31.33 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  28.03 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  36.88 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  30.61 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  31.78 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  23.89 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  24.71 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  28.99 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.94 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  28.26 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  31.01 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  31.79 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  32.62 
 
 		 333 aa  63.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  26.67 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  29.5 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  29.5 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  30.66 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  31.36 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  28.75 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  31.28 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  31.43 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  31.01 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  26.11 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  29.3 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  32.23 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  33.06 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  25.45 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  33.06 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  33.06 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  33.06 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  34.18 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.71 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  32.12 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  22.16 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  31.38 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  22.62 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  26.36 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  27.88 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  25.15 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  22.62 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  27.33 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  24.49 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  31.1 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.26 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  29.58 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  24.49 
 
 		 345 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>