119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3404 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 170 aa  329  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  40.54 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  38.26 
 
 		 195 aa  73.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  37.14 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.48 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  32.77 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  32.77 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  32.77 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04767  hypothetical protein  33.61 
 
 		 365 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  31.9 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  29.68 
 
 		 215 aa  62  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3249  hypothetical protein  33.06 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  35.88 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.03 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  37.61 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.67 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  33.1 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  27.92 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  32.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  31.9 
 
 		 270 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  25.86 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.17 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  30.33 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  30.33 
 
 		 267 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.37 
 
 		 256 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  29.84 
 
 		 337 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  29.05 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  27.56 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  31.85 
 
 		 231 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.82 
 
 		 250 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  25.79 
 
 		 262 aa  51.6  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  29.68 
 
 		 245 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  31.51 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  30.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  34.56 
 
 		 256 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  27.62 
 
 		 262 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  29.66 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  42.17 
 
 		 264 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.85 
 
 		 284 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  33.9 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.42 
 
 		 250 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.59 
 
 		 263 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  31.13 
 
 		 230 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  35.59 
 
 		 348 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.88 
 
 		 282 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  31.13 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  31.13 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  24.39 
 
 		 256 aa  48.5  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  32.74 
 
 		 338 aa  48.5  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.88 
 
 		 251 aa  48.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  26.9 
 
 		 188 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  33.33 
 
 		 270 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.33 
 
 		 237 aa  47.4  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  38.95 
 
 		 224 aa  47.4  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  31.9 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.57 
 
 		 237 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.27 
 
 		 263 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  27.91 
 
 		 280 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  27.89 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  33.11 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  31.3 
 
 		 250 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.99 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  33.72 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  28.36 
 
 		 280 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  22.73 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 253 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  30.51 
 
 		 258 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  27.46 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  27.93 
 
 		 259 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  25.95 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  25.95 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  22.08 
 
 		 192 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  30.6 
 
 		 252 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  29.53 
 
 		 210 aa  44.7  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  27.93 
 
 		 264 aa  43.9  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.39 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.34 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  22.08 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.39 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  21.38 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.74 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  26.05 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  22.08 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  22.08 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  22.08 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  22.08 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  24.8 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  27.55 
 
 		 342 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  29.75 
 
 		 334 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  26.72 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  33.62 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>