263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1689 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  356  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  65.07 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  40 
 
 
188 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  41.13 
 
 
205 aa  100  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  39.2 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  48.76 
 
 
198 aa  99  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  35 
 
 
228 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  36.6 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  42.62 
 
 
209 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  40.98 
 
 
315 aa  90.5  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  40 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  38.46 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  37.41 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  35.8 
 
 
212 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  36.05 
 
 
202 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  40.31 
 
 
210 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  40.98 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  37.59 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  36.57 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  39.52 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  39.52 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1930  protein of unknown function DUF218  42.18 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000562665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  34.56 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  37.9 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  36.07 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  35.29 
 
 
461 aa  74.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  36.89 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  28.38 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  36.29 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  29.11 
 
 
194 aa  72  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  34.15 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  35.44 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  33.1 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  30.4 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  28.06 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  30.47 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  31.75 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  31.97 
 
 
257 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  32.33 
 
 
322 aa  64.7  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  32.33 
 
 
322 aa  64.7  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
256 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  29.75 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  33.07 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  29.66 
 
 
216 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  29.8 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  28.67 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  28.57 
 
 
206 aa  62.4  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  31.5 
 
 
223 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  34.56 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  28.57 
 
 
249 aa  62  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  27.69 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  28.57 
 
 
206 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  31.01 
 
 
318 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  29.93 
 
 
257 aa  60.5  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  34.15 
 
 
236 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  25.85 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  25.9 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  23.98 
 
 
222 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  26.45 
 
 
185 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  31.11 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  34.19 
 
 
226 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 
262 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  31.11 
 
 
230 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  31.11 
 
 
230 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  30.82 
 
 
224 aa  58.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  33.59 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 
217 aa  58.2  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.86 
 
 
265 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>