188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1256 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  96.89 
 
 
257 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  36.47 
 
 
258 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  35.09 
 
 
262 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  47.9 
 
 
256 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  32.51 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  41.94 
 
 
342 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  36.71 
 
 
336 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  44.09 
 
 
322 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  44.09 
 
 
322 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  31.56 
 
 
345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  40.24 
 
 
333 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  29.15 
 
 
345 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  36.65 
 
 
192 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  29.2 
 
 
345 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1229  protein of unknown function DUF218  33.85 
 
 
378 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4938  hypothetical protein  29.64 
 
 
344 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  29.2 
 
 
345 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  29.2 
 
 
345 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  36.6 
 
 
344 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1950  hypothetical protein  43.2 
 
 
318 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  36.6 
 
 
344 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  35.95 
 
 
344 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  39.29 
 
 
206 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  35.95 
 
 
345 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  35.37 
 
 
194 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  30.58 
 
 
246 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  38.32 
 
 
206 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  34.16 
 
 
393 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  35.62 
 
 
172 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  35.62 
 
 
192 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  35 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  35.29 
 
 
345 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  31.29 
 
 
280 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  35 
 
 
159 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  32.75 
 
 
271 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  35.03 
 
 
185 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  34.81 
 
 
185 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  39.6 
 
 
195 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  92.8  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  34.18 
 
 
178 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  31.93 
 
 
253 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  30.53 
 
 
259 aa  92  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  32.92 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  33.12 
 
 
193 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0865  protein of unknown function DUF218  35.33 
 
 
350 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  33.54 
 
 
185 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  35.58 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1839  hypothetical protein  37.01 
 
 
373 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.07336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  32.91 
 
 
185 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  28.08 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  31.86 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  33.92 
 
 
348 aa  85.9  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07170  hypothetical protein  35.15 
 
 
338 aa  85.5  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  29.2 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  32.7 
 
 
365 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1892  hypothetical protein  31.65 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0463  hypothetical protein  36.13 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  27.07 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  27.53 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  27.07 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.7 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  27.78 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  30.99 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  28.43 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  24.71 
 
 
245 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  29.41 
 
 
165 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  24.4 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  24.84 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  31.98 
 
 
334 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 
346 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  34.45 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  29.93 
 
 
176 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  34.45 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  30.43 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  26.17 
 
 
278 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  31.69 
 
 
181 aa  58.5  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  21.95 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  29.6 
 
 
153 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  32.26 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  28.37 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  27.45 
 
 
215 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  28.78 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.82 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>