208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06205 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  47.17 
 
 
216 aa  207  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  43.58 
 
 
223 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  47.49 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  40 
 
 
226 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  37.96 
 
 
219 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  38.35 
 
 
225 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  44.31 
 
 
215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  43.2 
 
 
229 aa  142  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  37.91 
 
 
225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  42.59 
 
 
230 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  40.76 
 
 
233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  42.42 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  40.46 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  38.12 
 
 
244 aa  132  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  34.91 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  34.91 
 
 
230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  34.91 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  34.91 
 
 
230 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  37.88 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  40.59 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  34.83 
 
 
210 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  34.13 
 
 
230 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  34.13 
 
 
230 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  39.29 
 
 
226 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  34.13 
 
 
230 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  35.58 
 
 
227 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  36.54 
 
 
230 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  34.62 
 
 
227 aa  121  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  35.1 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  41.61 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  34.13 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  34.62 
 
 
227 aa  118  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  36.18 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  38.82 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  37.71 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  38.55 
 
 
216 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  35.36 
 
 
221 aa  112  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  35.64 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  31.6 
 
 
251 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  36.16 
 
 
231 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  31.79 
 
 
201 aa  101  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  29.86 
 
 
247 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  30.81 
 
 
245 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  31.05 
 
 
245 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  31.05 
 
 
245 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  30.96 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  35.75 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  30.88 
 
 
250 aa  95.9  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  30.61 
 
 
259 aa  95.5  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  33.51 
 
 
190 aa  95.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  36.13 
 
 
237 aa  94.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  32.92 
 
 
183 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  32.63 
 
 
239 aa  91.7  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  32.48 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  32.16 
 
 
192 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  33.15 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  34.38 
 
 
189 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  37.01 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  32.72 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  34.56 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.73 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  31.48 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  32.8 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  27.5 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  30.52 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  27.89 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.46 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  28.43 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  27.92 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  27.4 
 
 
199 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  31.65 
 
 
322 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  31.65 
 
 
322 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  29.91 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  28.77 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  25 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  26.32 
 
 
178 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  27.4 
 
 
207 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  26.12 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  26.12 
 
 
230 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  26.12 
 
 
230 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  23.84 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  28.46 
 
 
185 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>