94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1566 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  84.49 
 
 
245 aa  427  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  84.49 
 
 
245 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  84.08 
 
 
245 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  88.73 
 
 
239 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  88.26 
 
 
239 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  80.24 
 
 
259 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  83.12 
 
 
259 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  80.93 
 
 
239 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  80.93 
 
 
239 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  80.93 
 
 
239 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  80.93 
 
 
239 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  80.93 
 
 
239 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  73.28 
 
 
251 aa  376  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  72.65 
 
 
250 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  54.98 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  50.44 
 
 
224 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  51.14 
 
 
244 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  49.53 
 
 
225 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  45.05 
 
 
231 aa  186  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  41.71 
 
 
222 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  44.26 
 
 
268 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  39.89 
 
 
201 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  40.18 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  39.82 
 
 
230 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  39.82 
 
 
230 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  40.18 
 
 
230 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  40.18 
 
 
230 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  40.18 
 
 
230 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  39.82 
 
 
230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  40.48 
 
 
210 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  39.82 
 
 
230 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  40.18 
 
 
230 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  39.73 
 
 
227 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  39.27 
 
 
227 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  39.27 
 
 
227 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  39.27 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  38.15 
 
 
217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  32.24 
 
 
216 aa  128  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  32.32 
 
 
233 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  35.27 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  37.23 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 
236 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  38.04 
 
 
270 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  28.11 
 
 
226 aa  105  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  101  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  29.86 
 
 
219 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  32.27 
 
 
216 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  35.88 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  34.62 
 
 
230 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  25.23 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  38.32 
 
 
216 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  37.4 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  34.9 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  36.22 
 
 
201 aa  79  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  28.18 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  33.07 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  37.07 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  33.59 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  29.65 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  29.84 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.11 
 
 
199 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.07 
 
 
192 aa  55.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  30.34 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  26.55 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  26.21 
 
 
181 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  29.46 
 
 
215 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  23.53 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  23.62 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.79 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  25 
 
 
193 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  25.48 
 
 
189 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  26.45 
 
 
195 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  23.53 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  23.08 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  25.26 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  23.96 
 
 
256 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  30.71 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 
262 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  30.71 
 
 
205 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  26.57 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.42 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  26.67 
 
 
219 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  26.06 
 
 
315 aa  42  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>