95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2419 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  93.72 
 
 
239 aa  435  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  93.31 
 
 
239 aa  432  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  89.96 
 
 
239 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  80.93 
 
 
247 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  78.81 
 
 
245 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  78.81 
 
 
245 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  78.81 
 
 
245 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  79.08 
 
 
259 aa  384  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  78.79 
 
 
259 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  74.15 
 
 
250 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  75.44 
 
 
251 aa  360  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  55.73 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  53.3 
 
 
224 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  51.9 
 
 
244 aa  210  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  47.44 
 
 
225 aa  208  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  44.81 
 
 
231 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  45.65 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  40.1 
 
 
222 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  40.71 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  40.71 
 
 
230 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  40.27 
 
 
230 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  40.27 
 
 
230 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  39.38 
 
 
227 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  40.27 
 
 
230 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  39.82 
 
 
227 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  40.19 
 
 
210 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  40.19 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  39.73 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  40.19 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  39.82 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  39.38 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  39.73 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  38.25 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  38.55 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  31.82 
 
 
233 aa  119  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  31.78 
 
 
216 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  33 
 
 
236 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  30.56 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  36.41 
 
 
225 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  35.87 
 
 
248 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  37.5 
 
 
270 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  34.67 
 
 
216 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  26.55 
 
 
219 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  29.14 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  38.32 
 
 
216 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  31.94 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  34.71 
 
 
226 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  33.95 
 
 
236 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  35.67 
 
 
231 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  32.34 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  37.01 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  32.16 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  31.21 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  26.67 
 
 
215 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  29.92 
 
 
183 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.97 
 
 
176 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  52.8  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.29 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  23.56 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  26.15 
 
 
209 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  26.21 
 
 
181 aa  48.9  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  24.79 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  23.65 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.53 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  32 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  20.91 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  25.35 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  20.91 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  20.91 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  20.91 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  24.68 
 
 
195 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  29.13 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.06 
 
 
199 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  22.47 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  29.13 
 
 
205 aa  42  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  23.42 
 
 
185 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  21.84 
 
 
204 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>