118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1272 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  100 
 
 
225 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  61.34 
 
 
221 aa  264  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  58.33 
 
 
244 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  63.02 
 
 
224 aa  256  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  49.53 
 
 
247 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  49.52 
 
 
251 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  51.53 
 
 
259 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  51.02 
 
 
259 aa  205  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  49.48 
 
 
245 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  49.48 
 
 
245 aa  203  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  49.48 
 
 
245 aa  203  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  46.26 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  51.06 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  49.74 
 
 
239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  49.74 
 
 
239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  49.74 
 
 
239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  49.74 
 
 
239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  49.74 
 
 
239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  49.47 
 
 
239 aa  198  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  46.11 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  41.38 
 
 
222 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  40.96 
 
 
217 aa  153  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  35.53 
 
 
230 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  40.66 
 
 
201 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  44.19 
 
 
268 aa  151  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  39.22 
 
 
216 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  35.09 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  35.09 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  36.15 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  35.09 
 
 
230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  36.15 
 
 
227 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  35.68 
 
 
227 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  40.33 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  40.33 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  40.91 
 
 
210 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  40.91 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  40.33 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  35.68 
 
 
227 aa  142  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  33.77 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  37.91 
 
 
219 aa  139  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  38.01 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  29.55 
 
 
219 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  30.59 
 
 
225 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  35.07 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  35.23 
 
 
230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  33.17 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  34.34 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  39.18 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  35.47 
 
 
231 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  34.69 
 
 
236 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 
236 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  32.6 
 
 
213 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  33.02 
 
 
223 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  33.65 
 
 
216 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  33.01 
 
 
216 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  31.25 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  33.13 
 
 
215 aa  92  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  35.1 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  33.96 
 
 
201 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  26.92 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  29.61 
 
 
183 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.11 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  33.56 
 
 
193 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.12 
 
 
189 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  24.4 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  24.4 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  24.4 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  25.42 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  24.4 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  24.4 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  30.26 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  25.95 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  25.95 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  28.24 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  25.95 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  23.81 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  28.06 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  25.86 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  22.68 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  25.2 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  25.75 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  26.46 
 
 
194 aa  46.2  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  24.22 
 
 
185 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  26.52 
 
 
228 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>