114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3378 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  95.59 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  95.59 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  96.04 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  95.15 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  94.64 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  94.64 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  94.64 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  91.07 
 
 		 230 aa  424  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  73.66 
 
 		 230 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  73.66 
 
 		 230 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  73.66 
 
 		 230 aa  355  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  73.66 
 
 		 230 aa  355  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  75.24 
 
 		 210 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  38.39 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  40.89 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  41.18 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  42.21 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  40.18 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  36.15 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  43.89 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  40.59 
 
 		 259 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  40.7 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  40 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  38.31 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  42.13 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  39.9 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  39.9 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  39.42 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  40.34 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  40.89 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  41.45 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  37.99 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  38.89 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  39.18 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  35.58 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  41.44 
 
 		 248 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  43.11 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  38 
 
 		 216 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  40.35 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  41.92 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  39.29 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  41.61 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  40.57 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  28.77 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  36.62 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  32.2 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  35.05 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  29.21 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  31 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  37.06 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  38.24 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  36.08 
 
 		 201 aa  92.4  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  27.27 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  34.17 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  37.88 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.21 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  36.61 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  26.9 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  26.02 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  24.84 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  28.95 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  28.05 
 
 		 461 aa  50.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  28.33 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  28.33 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  22.88 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  30.37 
 
 		 188 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  27.73 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  26.92 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  29.75 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  29.75 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  29.75 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  25.22 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  29.6 
 
 		 315 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  25.75 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  26 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  29.13 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  26.47 
 
 		 210 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  26.59 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.59 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.59 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.59 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>