96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3021 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  503  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  503  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  84.49 
 
 
247 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  80.51 
 
 
239 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  80.08 
 
 
239 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  78.81 
 
 
239 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  78.81 
 
 
239 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  78.81 
 
 
239 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  78.81 
 
 
239 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  78.81 
 
 
239 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  77.78 
 
 
239 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  75.82 
 
 
259 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  76.33 
 
 
259 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  72.47 
 
 
251 aa  362  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  72.88 
 
 
250 aa  357  9e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  53.7 
 
 
244 aa  225  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  54.11 
 
 
221 aa  224  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  52.31 
 
 
224 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  46.41 
 
 
225 aa  208  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  49.22 
 
 
231 aa  193  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  40 
 
 
222 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  43.82 
 
 
268 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  40.91 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  40.98 
 
 
201 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  38.74 
 
 
230 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  38.74 
 
 
230 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  38.74 
 
 
230 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  38.74 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  39.53 
 
 
210 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  38.99 
 
 
227 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  37.61 
 
 
230 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  37.61 
 
 
230 aa  138  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  37.61 
 
 
230 aa  138  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  37.61 
 
 
227 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  37.61 
 
 
227 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  37.39 
 
 
227 aa  136  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  37.84 
 
 
230 aa  135  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  37.61 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  37.02 
 
 
217 aa  132  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  33.64 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  30.81 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  38.04 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  35.61 
 
 
225 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  35.87 
 
 
248 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  30.62 
 
 
219 aa  105  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  30.24 
 
 
236 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  31.11 
 
 
213 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  28.37 
 
 
226 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  29.47 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  33.88 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  34.12 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  37.72 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  29.95 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  29.05 
 
 
223 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  36.59 
 
 
236 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  34.18 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  35 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  29.41 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  32.26 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  29.65 
 
 
190 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  28.75 
 
 
189 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.59 
 
 
192 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  28.35 
 
 
183 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.72 
 
 
176 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.62 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.05 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  32.46 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  26.57 
 
 
193 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.09 
 
 
205 aa  48.9  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  23.03 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  24.83 
 
 
181 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  26.23 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  30.25 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  30.25 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  25.81 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  23.39 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  26.95 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  25.57 
 
 
281 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  26.76 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  26.57 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  28.23 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0119  protein of unknown function DUF218  25.26 
 
 
348 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422825  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  25.87 
 
 
192 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  23.42 
 
 
185 aa  42.4  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  27.86 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  27.86 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  26.67 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>