204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003183 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  428  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  98.54 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  33.59 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  36 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  28.95 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  30.37 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  27.81 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  31.88 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.01 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  36.27 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  25.68 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  32.2 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  32.2 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  25.34 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  31.03 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  27.65 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  31.2 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  29.03 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.49 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.49 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  26.4 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  26.4 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  23.2 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  35 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.45 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  26.87 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  30.4 
 
 		 342 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  32.59 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  31.45 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  35.58 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  28.46 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.46 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  22.65 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  27.87 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  28.33 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.85 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  26.87 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  27.42 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  25.78 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  28 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  30.69 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  30.69 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  29.79 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  24.67 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  29.79 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  30.69 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  27.64 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  30.69 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.17 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  26.52 
 
 		 266 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  30.95 
 
 		 178 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.38 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  29.9 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  28.3 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  25.6 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  29.79 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.72 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  25.95 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  25.83 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  29.49 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  48.5  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  26.67 
 
 		 250 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  29.55 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  29.63 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  32.11 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 		 278 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  30.12 
 
 		 185 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  28.87 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.94 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  23.23 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.09 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 		 256 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0171  hypothetical protein  27.91 
 
 		 365 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  27.66 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  24.6 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  23.68 
 
 		 280 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.95 
 
 		 265 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>