175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3100 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  42.08 
 
 		 189 aa  141  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  36.13 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  44.93 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  42.33 
 
 		 248 aa  107  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  32.98 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  39.77 
 
 		 225 aa  104  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  38.37 
 
 		 270 aa  101  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  40.62 
 
 		 230 aa  101  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  31.22 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  37.85 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  39.6 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  41.29 
 
 		 231 aa  97.8  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  38.64 
 
 		 201 aa  97.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  33.51 
 
 		 219 aa  95.1  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  39.45 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  32.91 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  34.52 
 
 		 212 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  37.11 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  34.86 
 
 		 226 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  35.48 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  35.2 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  34.75 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  28.28 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  27.62 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  27.89 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  29.14 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  26.92 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  29.76 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  34.81 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  30.19 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  30.19 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  30.19 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  32.02 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  30.23 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  32.02 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  32.02 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  32.02 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  27.66 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  33.61 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  31.48 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  28.26 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  26.97 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  31.48 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  35.34 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  32.1 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  32.1 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  32.1 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  32.1 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  32.1 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  32.1 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.75 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  27.32 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  26.9 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  27.42 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  26.61 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  26.61 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  27.71 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3664  hypothetical protein  27.01 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.98369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  27.89 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  27.88 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  29.8 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  30.28 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  26.61 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  29.65 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  31.97 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  27.49 
 
 		 262 aa  61.2  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  32.41 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  25.81 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1680  hypothetical protein  27.5 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  30.34 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  27.07 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  25.73 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  29.41 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  24.71 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  29.81 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  35.9 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  26.97 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  31.13 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  31.13 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  31.1 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  32.64 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  29.63 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>