97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1238 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  479  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  38.46 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  40.1 
 
 
245 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  40.1 
 
 
245 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  39.83 
 
 
244 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  39.61 
 
 
245 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  40.78 
 
 
221 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  41.43 
 
 
224 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  40.1 
 
 
247 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  39.72 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  40.91 
 
 
239 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  40.85 
 
 
251 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  41.84 
 
 
250 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  40.4 
 
 
239 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  40.95 
 
 
239 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  42.41 
 
 
259 aa  142  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  42.41 
 
 
259 aa  142  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  40.83 
 
 
231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 
201 aa  131  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  42.47 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  36.57 
 
 
230 aa  121  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  39.49 
 
 
236 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  37.02 
 
 
227 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  36.57 
 
 
230 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  36.57 
 
 
230 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  36.57 
 
 
230 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  42.61 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  42.61 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  42.61 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  42.61 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  42.61 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  37.02 
 
 
227 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  36.54 
 
 
227 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  36.54 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  36.54 
 
 
227 aa  118  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  38.1 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  35.2 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  41.32 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  29.67 
 
 
219 aa  112  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  35.91 
 
 
225 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  30.48 
 
 
216 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  41.92 
 
 
270 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  40.12 
 
 
268 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  40.36 
 
 
226 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  38.62 
 
 
216 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  32.43 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  32.06 
 
 
215 aa  92.8  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  36.1 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  35.81 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  31.84 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  35.46 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  38.51 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  37.32 
 
 
183 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  31.16 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  27.37 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  28.97 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  29.03 
 
 
181 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.04 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  33.05 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  28.48 
 
 
188 aa  46.2  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  20.38 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  20.38 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  20.38 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  20.38 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  20.38 
 
 
210 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  31.3 
 
 
210 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  20.71 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  36.26 
 
 
153 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  27.66 
 
 
206 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  28.17 
 
 
176 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  26.45 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  25.58 
 
 
189 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  30.33 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  30.33 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  30.33 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  31.52 
 
 
221 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  24.44 
 
 
185 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>