181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4335 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  42.08 
 
 		 190 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  42.17 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  41.88 
 
 		 230 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  47.14 
 
 		 236 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  44.97 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  45.33 
 
 		 216 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  45.99 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  51.26 
 
 		 216 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  40.72 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  37.34 
 
 		 225 aa  104  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  36.88 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  37.22 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  40.43 
 
 		 270 aa  92.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  39.34 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  27.08 
 
 		 219 aa  91.7  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3579  SanA protein  39.04 
 
 		 230 aa  91.3  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  33.55 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  38.85 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3413  SanA protein  37.65 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  37.65 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3409  SanA protein  38.36 
 
 		 230 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3483  SanA protein  38.36 
 
 		 230 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3517  hypothetical protein  38.36 
 
 		 230 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743597  hitchhiker  0.000023852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  35.19 
 
 		 223 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  36.08 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2226  protein of unknown function DUF218  34.08 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0993936  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  32.08 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  39.39 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  39.39 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  39.39 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  39.39 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  32.72 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  40 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  37.1 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3522  putative SanA protein  38.64 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3268  putative SanA protein  38.64 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3553  putative SanA protein  41.28 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3378  putative SanA protein  37.88 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.613446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  31.01 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2531  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.379289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2330  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2374  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2419  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2423  hypothetical protein  32.28 
 
 		 239 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  33.55 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2215  protein of unknown function DUF218  34.33 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2747  hypothetical protein  34.53 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.608544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  32.56 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0827  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02073  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1514  protein of unknown function DUF218  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02032  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3276  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2278  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2439  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1504  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2291  hypothetical protein  33.81 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  30.81 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  28.95 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1943  hypothetical protein  32.37 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  30.34 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  31.1 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1566  hypothetical protein  33.59 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  30.49 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2403  hypothetical protein  33.59 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.655564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  25.83 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  25.83 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1672  hypothetical protein  33.09 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.485835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  25.83 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  36.15 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2304  hypothetical protein  32.9 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1077  SanA protein  30 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000060635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  25.57 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  31.06 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  24.02 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  32.82 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  32.09 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2333  sanA protein, putative  31.67 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.182308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1238  hypothetical protein  30.26 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.56645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2464  hypothetical protein  30.94 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3021  hypothetical protein  30.94 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0104814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  24.44 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2563  hypothetical protein  30.94 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  32.12 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  29.17 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  31.08 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  26.47 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  33.59 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  26.95 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>