258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4635 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  34.05 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  34.59 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  35.8 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  35.8 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  35.8 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0757  hypothetical protein  34.83 
 
 
207 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482457  hitchhiker  0.00142809 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  33.55 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  34.38 
 
 
219 aa  85.1  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 
199 aa  84.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  35.76 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  38.22 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  36.99 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  37.88 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  31.25 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  31.29 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  34.93 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  30.51 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  31.29 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  37.01 
 
 
270 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  36.81 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 
248 aa  77.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  33.54 
 
 
245 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2008  hypothetical protein  29.81 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.456188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  36.05 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01910  uncharacterized membrane protein  34.33 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.850313  normal  0.329563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  36.43 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  36.84 
 
 
209 aa  72  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  39.02 
 
 
333 aa  71.2  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  28.04 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  29.66 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  33.61 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  27.93 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  39.02 
 
 
336 aa  67.8  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  37.18 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2646  protein of unknown function DUF218  27.92 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  27.44 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  34.13 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  27.97 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  37.82 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  30.14 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  35.29 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  33.12 
 
 
280 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  26.83 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  30.71 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0889  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.779041  hitchhiker  0.000145326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4335  protein of unknown function DUF218  36.15 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  34.48 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  34.38 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  30.18 
 
 
210 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.56 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  31.65 
 
 
345 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.56 
 
 
182 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  33.57 
 
 
246 aa  61.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  35.19 
 
 
342 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02033  hypothetical protein  31.86 
 
 
244 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  28.48 
 
 
262 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  30.58 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0430  hypothetical protein  30.7 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0807  sanA protein  34.19 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  36.44 
 
 
322 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  36.44 
 
 
322 aa  60.1  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  34.26 
 
 
217 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  39.13 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  39.13 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  39.13 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.25 
 
 
461 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 
256 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  39.13 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  30.32 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  30.32 
 
 
192 aa  58.9  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3100  protein of unknown function DUF218  35.9 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  31.01 
 
 
345 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  30.72 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  30.32 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  32.08 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  30.72 
 
 
192 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  36.84 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  32.1 
 
 
370 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  26.35 
 
 
346 aa  58.2  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1788  hypothetical protein  31.17 
 
 
159 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  28.47 
 
 
196 aa  57.8  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0832  hypothetical protein  28.81 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000170655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003738  SanA protein  30.97 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.6 
 
 
242 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1272  vancomycin resistance protein SanA  27.12 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.732001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>