279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1256 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  35.8 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  41.51 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  40.82 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  37.25 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0298  protein of unknown function DUF218  41.46 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2325  hypothetical protein  39.31 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  38.67 
 
 		 336 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3404  protein of unknown function DUF218  41.38 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  36.73 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  35.95 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  37.69 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.69 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  34.07 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  34.07 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  29.45 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  32.56 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  34.82 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  30.97 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  30.97 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  31.21 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  27.66 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  30.97 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  27.66 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  28.47 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0466  protein of unknown function DUF218  37.7 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  33.02 
 
 		 263 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1036  protein of unknown function DUF218  37.31 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30.36 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  26.45 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  29.2 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04460  uncharacterized membrane protein  37.7 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  34.55 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  34.33 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1706  protein of unknown function DUF218  31.08 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.080419  hitchhiker  1.73003e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.38 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.48 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  26.25 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  31.41 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  29.81 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6010  hypothetical protein  37.1 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0036076  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.17 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  31.03 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  26.95 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  33.62 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.35 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  29.14 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  29.14 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  31.48 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  33.58 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  36.61 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  28.12 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  38.39 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  27.09 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  29.11 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  38.39 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  26.27 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  30.43 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4400  putative SanA protein  29.82 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.801219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  27.98 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.56 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  33.56 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02955  predicted thioredoxin-like protein  29.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0615  protein of unknown function DUF218  29.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.319627  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02905  hypothetical protein  29.82 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  33.09 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5353  hypothetical protein  26.83 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00600694  normal  0.075763 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  33.33 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  26.83 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4935  hypothetical protein  26.83 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000188472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  32.45 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0614  hypothetical protein  29.82 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  33.33 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.79 
 
 		 258 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  32.45 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  30.57 
 
 		 315 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0469  protein of unknown function DUF218  35.54 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.365925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  39.68 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  31.3 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  32.45 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  29.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  26.98 
 
 		 271 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>