93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1349 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  63.78 
 
 		 219 aa  278  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  65.13 
 
 		 197 aa  275  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  64.61 
 
 		 196 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  60.96 
 
 		 196 aa  247  9e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  55.61 
 
 		 196 aa  241  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  60.11 
 
 		 235 aa  238  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.49 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.77 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  36.03 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.61 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  38 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  27.66 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  36.36 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.36 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  31.31 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  31.31 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  33.93 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.86 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  25.49 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  32.73 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  28.32 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  34.51 
 
 		 461 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  29.61 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  28.47 
 
 		 279 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  24.36 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  26.28 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  30.25 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  26.35 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  28.12 
 
 		 252 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.32 
 
 		 262 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  25.78 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  42.55 
 
 		 249 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  26.9 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  42.55 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  42.55 
 
 		 237 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.15 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.49 
 
 		 262 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  25.32 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  42.55 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  24.09 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  25.14 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  22.11 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  24.46 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  30.83 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  26.8 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.97 
 
 		 252 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  30.43 
 
 		 263 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  29.35 
 
 		 258 aa  45.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  26.92 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  27.13 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  24.22 
 
 		 281 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  23.53 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  23.44 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  26.15 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3427  hypothetical protein  32.93 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  31.03 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  27.41 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  20.88 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  25.83 
 
 		 266 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3213  group-specific protein  29.59 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  25.52 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  26.32 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  29.66 
 
 		 370 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  20.92 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  26.52 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  23.53 
 
 		 245 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  24.41 
 
 		 251 aa  41.6  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  24.18 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.61 
 
 		 237 aa  41.6  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 		 248 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  22.09 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.34 
 
 		 256 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>