133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1343 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  71.96 
 
 		 193 aa  278  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  33.55 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  34.21 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.24 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.24 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  29.89 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  29.89 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  36.76 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  33.8 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.56 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  29.94 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.6 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  28.87 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.48 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  26.92 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  28.83 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  26.92 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  35.71 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  26.92 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  24.46 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  29.2 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  26.67 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.23 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  34.13 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  32.4 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  24.08 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.44 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.6 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  32.35 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  25.87 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  25.71 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  27.55 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  31.95 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  24.28 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  27.7 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  25.14 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  25.29 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  25.14 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.87 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  28.65 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  30.2 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  31.79 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  24.82 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.32 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  36.07 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  31.64 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  25.48 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  32.08 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.12 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  25.27 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  32.03 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0746  protein of unknown function DUF218  29.45 
 
 		 370 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  32.28 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  22.11 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  26.87 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  23.27 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3216  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101173  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  31.43 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  21.39 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  34.65 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  32.14 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  32.73 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  23.53 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  30.83 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  29.17 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.15 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.15 
 
 		 265 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  22.51 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.71 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  31.5 
 
 		 282 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  28.83 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.55 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  23.81 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  26.35 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  32.26 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.25 
 
 		 280 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  23.77 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  29.29 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  20 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.21 
 
 		 280 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  33.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  32.05 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  29.84 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  24.6 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.37 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1272  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  25.62 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06790  uncharacterized membrane protein  24.69 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.979895 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>