50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2970 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
211 aa  414  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  30.11 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  34.19 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  29.81 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.43 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  34.16 
 
 
193 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  25.13 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  27.61 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.08 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  27.74 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.59 
 
 
273 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  29.65 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  26.37 
 
 
280 aa  52  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  28.25 
 
 
246 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  31.79 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.94 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  34 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  29.74 
 
 
241 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  28.26 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  30.16 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  42.42 
 
 
259 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  30.57 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  31.55 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  28.85 
 
 
198 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  30.1 
 
 
241 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  24.69 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  26.9 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  25.41 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  29.09 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  27.22 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.61 
 
 
263 aa  45.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  25 
 
 
260 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  23.88 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  29.08 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  25.64 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  23.13 
 
 
265 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.37 
 
 
262 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  26.92 
 
 
197 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1984  protein of unknown function DUF218  29.24 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000111651  normal  0.0299035 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1458  hypothetical protein  31.03 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0910474  normal  0.0228469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1957  protein of unknown function DUF218  29.24 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  26.67 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  27.95 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.39 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  32.71 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  25.93 
 
 
212 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  27.74 
 
 
200 aa  41.6  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>