272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0467 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  31.82 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  32.97 
 
 
196 aa  91.7  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 
197 aa  89  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 
196 aa  86.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  26.98 
 
 
235 aa  85.5  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  29.21 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  28.49 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  32.39 
 
 
187 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  30.11 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  35.37 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  36 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  27.87 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  36 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.79 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.47 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  30.52 
 
 
189 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.47 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.89 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  29.49 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  25.5 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.19 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  34.68 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  34.68 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  36.27 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  26.82 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  26.82 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  35.14 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.14 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  29.08 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
245 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  27.7 
 
 
258 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.95 
 
 
281 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  29.33 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  27.31 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  30.53 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  31.4 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  29.61 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  29.61 
 
 
205 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.03 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  28.64 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  28.5 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  32.69 
 
 
238 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  26.67 
 
 
200 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  28.48 
 
 
198 aa  59.7  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  36.11 
 
 
212 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  28.24 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  27.44 
 
 
213 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  31.03 
 
 
210 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  30.77 
 
 
210 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.59 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  26 
 
 
206 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.11 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  34.19 
 
 
212 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  29.81 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0901  protein of unknown function DUF218  32.34 
 
 
201 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  31.05 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  28.21 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.55 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.19 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  30.36 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  29.44 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.61 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  31.76 
 
 
240 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  30 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  36.28 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  31.07 
 
 
194 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  36.99 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  25.49 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  29.66 
 
 
234 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  28.49 
 
 
207 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  25.79 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  27.56 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3069  protein of unknown function DUF218  33 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000320027 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  25.52 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  35.53 
 
 
193 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  26.35 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  31.17 
 
 
240 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  31.46 
 
 
210 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3559  hypothetical protein  21.5 
 
 
225 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  27.22 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3269  hypothetical protein  21.5 
 
 
251 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.106822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  25.5 
 
 
210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  25.5 
 
 
210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  25.5 
 
 
210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  25.5 
 
 
210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  29.03 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  25.5 
 
 
210 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  33.91 
 
 
185 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3299  hypothetical protein  21.5 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.23381  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  29.37 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  28.48 
 
 
191 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  31.37 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  34.21 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4671  hypothetical protein  30.97 
 
 
225 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.0210644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3447  hypothetical protein  26.85 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  34.21 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>