21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2846 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  29.48 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2745  protein of unknown function DUF218  25.5 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  27.64 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  29.22 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  28.5 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  28.93 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  28.36 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  29.76 
 
 		 238 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  28.99 
 
 		 196 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  31.1 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  30.54 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  26.37 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  30.99 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  27.55 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  28.14 
 
 		 191 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  29.41 
 
 		 241 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  28.72 
 
 		 226 aa  45.8  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  27.18 
 
 		 229 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  26.37 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>