48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3256 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  447  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  41.89 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  41.42 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  36.5 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  40.97 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  36.79 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  35.75 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  36.02 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  35.6 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  38.74 
 
 		 258 aa  118  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  38.37 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  35.08 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  35.27 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  40.36 
 
 		 245 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  39.2 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  34.43 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  35.38 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  39.13 
 
 		 234 aa  111  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  38.86 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  38.93 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  40.94 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  34.83 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  34.18 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  33.67 
 
 		 212 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  33.67 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  39.86 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  37.7 
 
 		 182 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  35.43 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  35.15 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  32.4 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  35.48 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  37.74 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  35.87 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  29.61 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  34 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2890  hypothetical protein  37.06 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.743347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  32.47 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.54 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.72 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  25.95 
 
 		 264 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  30.83 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.42 
 
 		 281 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.09 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3132  protein of unknown function DUF218  32.41 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.92 
 
 		 242 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>