109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0844 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  63.78 
 
 
196 aa  278  3e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  61.73 
 
 
197 aa  278  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  63.64 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  51.38 
 
 
235 aa  242  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  54.59 
 
 
196 aa  238  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  52.04 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  32.94 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.79 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  37.11 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  37.11 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.06 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  30.33 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  32.79 
 
 
190 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  34.78 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  28.5 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  34.78 
 
 
192 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2597  hypothetical protein  28.89 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.54 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.54 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  28.41 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  35.2 
 
 
185 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  32.79 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  23.12 
 
 
245 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1127  hypothetical protein  30.3 
 
 
252 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  25.48 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.75 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2611  hypothetical protein  25.66 
 
 
202 aa  52.8  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  31.3 
 
 
315 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  23.91 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
265 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  25.33 
 
 
189 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
265 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.21 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  28.97 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.86 
 
 
461 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  30.71 
 
 
195 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  34.09 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  26.87 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 
185 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  26.25 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  30.77 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  24.88 
 
 
241 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  22.84 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  33.9 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  20.41 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.15 
 
 
263 aa  48.1  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 
260 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 
279 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  24.69 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  23.4 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  24.74 
 
 
241 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0692  hypothetical protein  25.61 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0213382  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  25.95 
 
 
263 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  25.86 
 
 
228 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4868  hypothetical protein  27.59 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  30.53 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  22.16 
 
 
209 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  38.3 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  38.3 
 
 
237 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  26.72 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  23.29 
 
 
245 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  38.3 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  25.53 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  24.29 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  29.85 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  22.17 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  26.26 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  27.44 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  24.61 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  22.16 
 
 
300 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  38.3 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3516  hypothetical protein  22.54 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  21.61 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  23.39 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.6 
 
 
251 aa  43.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  28.42 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3299  hypothetical protein  22.54 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.23381  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  21.11 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  26.92 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  23.04 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  21.95 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  19.39 
 
 
199 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3269  hypothetical protein  22.54 
 
 
251 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.106822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.21 
 
 
251 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3559  hypothetical protein  22.54 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>