78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003835 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  83.02 
 
 		 212 aa  374  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  54.19 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  48.5 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  44.76 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  44.5 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  38.65 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  40.39 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  40.39 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  38.92 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  35.96 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  33 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  34.98 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  32.32 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  31.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  31.34 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  25.12 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  26.51 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  25.12 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  25.12 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  26.05 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  30 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  26.05 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  29.49 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  25.58 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  27 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  37.76 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  26.09 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  37.76 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  25.54 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  29.5 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  28.85 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  34.34 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  24.81 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  38.03 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.66 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.17 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.63 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32.65 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.12 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  34.04 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  27.87 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  29.9 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  34.83 
 
 		 280 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  31.03 
 
 		 153 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  31.75 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  48.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  26.25 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  31.5 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.42 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.29 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  32.8 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  33.67 
 
 		 336 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  29.55 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  29.55 
 
 		 249 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  29.55 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  28.46 
 
 		 272 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  34.38 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  30.21 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  21.95 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  31.97 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  31.08 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.21 
 
 		 281 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  29.6 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  28.41 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  24.04 
 
 		 264 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  29.03 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>