93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0237 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  50 
 
 		 222 aa  218  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  44.12 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  50 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  44.76 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  45.32 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  42.42 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  41.63 
 
 		 211 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  41.63 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  40.67 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  37.25 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  33.17 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  33.5 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  34.67 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  33.67 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  42.71 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  29.17 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1952  hypothetical protein  25.26 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1516  protein YdcF  26.73 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1699  hypothetical protein  26.27 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.216662  hitchhiker  0.00242518 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1760  protein YdcF  26.27 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1820  hypothetical protein  26.27 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  33.09 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1757  hypothetical protein  26.27 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  0.0972712 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  27.96 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  31.51 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  30.71 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  26.04 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.37 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1006  hypothetical protein  28.5 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0861939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  25.52 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  25.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  25.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  25.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  27.42 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.79 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  25.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.79 
 
 		 265 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  25.52 
 
 		 266 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  40.22 
 
 		 260 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  25.65 
 
 		 266 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  33.04 
 
 		 153 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30.25 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  27.75 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0901  protein of unknown function DUF218  25.12 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  28 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 336 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  32.29 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  26.87 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  27.75 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.33 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  27.93 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  26.03 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.84 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.33 
 
 		 265 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.33 
 
 		 278 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.87 
 
 		 280 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01239  DUF218 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G01750)  22.77 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  33.7 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  27.85 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  27.85 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  33.66 
 
 		 228 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.23 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  26.72 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.97 
 
 		 263 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5793  protein of unknown function DUF218  31.87 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0710  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  29.37 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.41 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  30.69 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  29.57 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  32.98 
 
 		 252 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0316  hypothetical protein  37.29 
 
 		 345 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1673  protein of unknown function DUF218  31.01 
 
 		 209 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4924  hypothetical protein  37.29 
 
 		 345 aa  42  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  28.91 
 
 		 251 aa  41.6  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  27.96 
 
 		 249 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  27.96 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  27.96 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1277  hypothetical protein  27.14 
 
 		 245 aa  41.6  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.995866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>