35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1708 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0049  protein of unknown function DUF218  53.67 
 
 
185 aa  187  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.291592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2273  protein of unknown function DUF218  44.3 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1575  hypothetical protein  36.84 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0763  hypothetical protein  34.22 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3967  hypothetical protein  35.26 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0764  hypothetical protein  32.52 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  32.79 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  32.53 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  29.33 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  37.27 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  28.28 
 
 
197 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  32.52 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  37.27 
 
 
218 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  29.05 
 
 
264 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  35.07 
 
 
259 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  30.83 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  30.83 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  26.06 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  30.28 
 
 
245 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  26.7 
 
 
241 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  31.01 
 
 
241 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  29.13 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  30.23 
 
 
238 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.86 
 
 
205 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  25.77 
 
 
265 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  25.77 
 
 
265 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1816  hypothetical protein  32.08 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0359339  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  31.19 
 
 
241 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.34 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  35.34 
 
 
190 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  28.08 
 
 
240 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26.71 
 
 
196 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2846  hypothetical protein  29.14 
 
 
280 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>