74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2460 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  100 
 
 		 185 aa  363  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  79.35 
 
 		 190 aa  286  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  82.07 
 
 		 192 aa  277  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  34.09 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  34.29 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  36.81 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  34.48 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  32.64 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.75 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  32.72 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  28.05 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  33.1 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  32.23 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  35.2 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  33.91 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  33.93 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  32.77 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  34.65 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.11 
 
 		 265 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  40.2 
 
 		 267 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  30.61 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  32.87 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  36.07 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  30.13 
 
 		 249 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  32.19 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  35.1 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  26.29 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  26.29 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.92 
 
 		 280 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  35.48 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  29.94 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  33.11 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  32.5 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  24.43 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  36.19 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  28.28 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  35.63 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.48 
 
 		 262 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  27.13 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  32.45 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30.46 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  34.26 
 
 		 195 aa  44.7  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  34.29 
 
 		 267 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  32.48 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.74 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  34.31 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  31.54 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  34.31 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.08 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  31.09 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.9 
 
 		 278 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.08 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  35.59 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  33.06 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.93 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  30.77 
 
 		 337 aa  42.4  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  32.1 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  35.65 
 
 		 253 aa  41.6  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  32.3 
 
 		 264 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2446  hypothetical protein  30.94 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.3 
 
 		 256 aa  41.2  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  28.82 
 
 		 238 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  30.65 
 
 		 250 aa  41.2  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  27.38 
 
 		 273 aa  41.2  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  34.88 
 
 		 262 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  30.29 
 
 		 461 aa  40.8  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>