78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  60.09 
 
 		 218 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  57.48 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  54.11 
 
 		 215 aa  244  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  39.9 
 
 		 222 aa  164  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0808  hypothetical protein  43 
 
 		 212 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  41 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  37.07 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  40.69 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  41 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  38.07 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  36.14 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  36.95 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  34.98 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3230  hypothetical protein  37.38 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37780  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000551578  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  27.54 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  29.5 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  28.19 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  28.19 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  26.81 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  28.19 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  28.3 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  28.3 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1295  protein of unknown function DUF218  27.33 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  27.52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  25.64 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  29.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.88 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30.58 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  36.36 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  35.35 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  35.78 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  27.22 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  33.59 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  33.59 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1758  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000726781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2020  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193127 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2231  protein of unknown function DUF218  25.11 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1595  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01369  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01381  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1497  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2244  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  30.28 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  25.77 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  32.73 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1634  hypothetical protein  24.66 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0558  hypothetical protein  33.63 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  34.74 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  31.18 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  32.73 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  29.75 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.5 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.5 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  26.87 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  30.17 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  20.96 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  33.7 
 
 		 249 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  33.7 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  33.7 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  38.36 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  32.61 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  42.62 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3988  protein of unknown function DUF218  34.78 
 
 		 433 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672563  normal  0.593684 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  28.1 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>