60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3480 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  32.39 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  33.59 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  33.59 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  28.11 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5542  hypothetical protein  31.49 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  27.57 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  35.48 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1279  protein of unknown function DUF218  31.07 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  33.81 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26.85 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1773  protein of unknown function DUF218  34.85 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.185676  normal  0.489345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  25.43 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  36.56 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01847  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  33.09 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  31.72 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  32.48 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1711  protein of unknown function DUF218  25.52 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.725568  hitchhiker  0.00117492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003835  hypothetical protein  29.5 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0887084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  24.52 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.71 
 
 		 256 aa  51.2  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 		 222 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  38.89 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  25.3 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  27.27 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  25.83 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  25.83 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  29.52 
 
 		 260 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  29.52 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  29.52 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  25.83 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  28.89 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  28.76 
 
 		 272 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  25.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  25.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  27.88 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  25.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  25.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  25.33 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  31.63 
 
 		 252 aa  45.1  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  27.5 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  23.49 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  21.34 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  24 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  30.12 
 
 		 301 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  24.65 
 
 		 206 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  32.46 
 
 		 279 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  28.93 
 
 		 219 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  29.21 
 
 		 210 aa  42  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  23.3 
 
 		 199 aa  41.6  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  24.55 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  31.46 
 
 		 251 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  29.17 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>